Karanteeni
Suomeen saapuvien laivojen karanteeni eli rutonvarjelussääntö uudistettiin. Aikana, jolloin ruttovaaraa ei ollut, laiva sai tulla vapaasti satamaan, jos sillä oli lähtösatamasta annettu "raittiustodistus". Kun ruttoa oli liikkeellä tai sitä epäiltiin, Suomeen tulevien laivojen piti tarkastuttaa itsensä Ruotsin karanteenilaitoksen asemalla. Se oli Känsön saarella Kattegatissa. Määräys ei koskenut Itämeren satamista tulleita laivoja.
Vakava ruttoepidemia oli Suomessa viimeksi vuonna 1711. Sitä oli kuitenkin edelleen Venäjällä ja itäisen Välimeren kaupungeissa. Siksi liikennettä sieltä vartioitiin tarkasti. Ruton häviäminen Länsi-Euroopasta johtui ilmeisesti juuri tehokkaasta karanteenista.
Muutkin kulkutaudit, sukupuolitaudit ja eläintaudit levisivät paljolti laivojen mukana.Useimpien tautien kohdalla leviämisherkkyyttä ei tiedetty tai sitä ei voitu mitenkään seurata. Taudit joka tapauksessa tulivat ensin satamakaupunkeihin ja levisivät niistä sisämaahan. Tavallista pahempia tautivuosia Suomessa olivat kaksi edellistä vuotta. Toissa vuonna Suomen väestöstä kuoli kolme prosenttia eli 53.000 henkeä.